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NEC發布基于AI的新型冠狀病毒疫苗設計基因分析結果

企業動態
本成果的分析結果展示了對世界多數人群安全有效、且亦能應對現在和將來的病毒多樣性的疫苗設計,同時也體現了NEC集團AI預測技術的技術水平高度。

   NEC日前發布了采用AI預測技術的基因分析結果,用于設計可促進全球多數人群T細胞反應的SARS-CoV-2(新型冠狀病毒)疫苗。本成果旨在幫助防止新型冠狀病毒感染癥“COVID-19”感染擴大,并支援全球疫苗開發,由NEC OncoImmunity AS與NEC歐洲研究所合作成立的研究團隊所取得。本研究應用了NEC與NECOncoImmunity在個體化癌癥疫苗開發中使用的AI預測技術。

  論文網站“bioRxiv”上發表的研究結果顯示,分析數千種SARS-CoV-2的基因組序列,鎖定了全球人群中最經常被找到的100個HLA等位基因(多種免疫型)的表位(可作為疫苗靶點)。

  具體來說,不僅使用預測算法分析了作為冠狀病毒名稱起源的表面刺突蛋白,還分析了SARS-CoV-2的全部蛋白,根據所得數據,對多個HLA等位基因型鎖定“熱點(HotSpot)”,該“熱點”重復包含了SARS-CoV-2蛋白中的共通表位。另外,充分采用本算法,優先選定了全球人群覆蓋最廣、且病毒蛋白中變異較少、今后也很難發生變異的保存區域中獲得的最佳熱點組。并且,為確保安全性,除去了病毒表位中與人類蛋白相似度高、特別是在重要臟器中發現的熱點。,為確

  本成果的分析結果展示了對世界多數人群安全有效、且亦能應對現在和將來的病毒多樣性的疫苗設計,同時也體現了NEC集團AI預測技術的技術水平高度。

  在公開本次研究成果、支援科學進步的同時,NEC將開啟以加快疫苗開發為目的的合作活動。

  NEC常務執行董事兼首席技術官西原基夫表示:“很高興NEC的AI技術能夠為當今世界面臨的嚴重問題做出貢獻。在世界各國都在為解決這一艱難課題而努力的情況下,NEC作為企業公民也有責任和義務參與到這一行動中。我們將以此次研究為開端,最大限度地活用AI技術這一NEC集團的優勢,與各種各樣的企業和機構合作,抑制新型冠狀病毒感染癥的擴大,為了讓全球的人們能夠盡早恢復日常生活而努力。”

  NECOncoImmunity的首席科學家Trevor Clancy博士表示:“敝公司首席執行官Richard Stratford博士和其團隊以及NEC集團,對于我們針對個體化癌癥免疫療法的機器學習軟件‘NEC Immune Profiler’從現在投入的癌癥領域迅速適應感染癥領域,并能夠為新型冠狀病毒感染癥的應對提供支持,感到非常振奮。我們的AI和生物信息平臺,不僅可以守護全球人類,而且對于現在和將來可能發生的新型冠狀病毒的多種變異版本,還能夠設計出可引發以長期記憶免疫反應等廣泛免疫反應的疫苗,這是一種很大的鼓勵。”

  NEC歐州研究所數據科學與系統平臺部門總經理SaverioNiccolini博士表示:“我們原本是為預測各個癌癥患者的免疫反應而設計的算法,應用到了大規模的感染癥群體。我們算法中的計算機驗證(insilico驗證)考慮到了人類在整個大陸的遺傳背景。目前,全球正受到日益擴大的新型冠狀病毒感染癥的威脅,我們的成果顯示了為阻止這一威脅的全球舉措做出貢獻的可能性,這是非常重要的。我們已開始與合作伙伴就wet-lab實驗進行協商,正在為開發出對全球多數人群有效的疫苗而邁出重要的一步。”

  論文信息

  標題:

  Artificial intelligence predicts the immunogenic landscape of SARS-CoV-2: toward universal blueprints for vaccine designs

  作者:

  Brandon Malone, Boris Simovski, Clément Moliné, Jun Cheng, Marius Gheorghe, Hugues Fontenelle, IoannisVardaxis, SimenTennøe, Jenny-Ann Malmberg, Richard Stratford, Trevor Clancy

  摘要URL:

  https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.21.052084v1

責任編輯:張誠 來源: 51cto
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